Регламент по разрешению споров РФС регулирует трудовые взаимоотношения между футболистами и тренерами с одной стороны и российскими футбольными клубами с другой. В случае появления долгов по зарплатам, премиальным и прочим выплатам, работники клубов пишут жалобы в Палату по разрешению споров РФС.

При этом одним из механизмов учета интересов работодателей является так называемый обеспечительный взнос. Он заключается в следующем: если клуб желает обжаловать наложенную на него в РФС санкцию, он вносит на счет РФС денежные средства. После этого с него снимается запрет на регистрацию новичков. В случае если клуб проигрывает апелляцию, работник получит положенные ему деньги со счета РФС. В случае выигрыша клубом апелляции, РФС возвращает средства ему. По словам спортивного юриста Михаила Прокопца, к данному механизму тоже есть вопросы. Он привел пример, когда несколько лет назад "Ростов" судился со своим бывшим главным тренером Курбаном Бердыевым.

— Бердыев выиграл на Палате по разрешению споров РФС, — рассказал Михаил Прокопец "Известиям". — "Ростов" обратился в CAS. Клубу запретили регистрировать новичков, а трансферное окно закрывалось через несколько дней. У "Ростова" был выбор: заплатить деньги Бердыеву, отказавшись от апелляции, или заплатить эти немаленькие деньги в РФС. Он заплатил РФС, запрет на регистрацию сняли. Клуб пошел в CAS, там дело тоже проиграл. Но что было бы, выиграй "Ростов" в Лозанне? Клуб заморозил приличную сумму денег примерно на полтора года, не может ими пользоваться. В итоге выигрывал бы в CAS, а РФС вернул бы ему деньги. За это время изменился курс рубля, клуб лишился возможностей купить футболистов, вложиться в инфраструктуру.